Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnf6Q9DBU5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnf6Q9DBU5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms