Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrpraQ9DBG7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrpraQ9DBG7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms