Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cmtm2aQ9DAR1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm2aQ9DAR1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms