Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Smim23Q9DAL0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smim23Q9DAL0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms