Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA6

Exosc1, Exosome complex component CSL4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc1Q9DAA6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Exosc1Q9DAA6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Exosc1Q9DAA6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms