Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sgf29Q9DA08 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sgf29Q9DA08 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms