Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Actrt1Q9D9J3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Actrt1Q9D9J3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms