Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Speer4bQ9D9F7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Speer4bQ9D9F7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms