Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9D9D9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Q9D9D9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms