Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SlirpQ9D8T7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SlirpQ9D8T7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms