Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rexo2Q9D8S4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rexo2Q9D8S4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms