Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9D8Q6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Q9D8Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9D8Q6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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