Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rpl4Q9D8E6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rpl4Q9D8E6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms