Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gbe1Q9D6Y9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gbe1Q9D6Y9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms