Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Ttc9bQ9D6E4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttc9bQ9D6E4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ttc9bQ9D6E4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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