Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lpcat2bQ9D5U0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms