Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc130Q9D516 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc130Q9D516 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms