Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lonrf3Q9D4H7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lonrf3Q9D4H7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms