Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clvs1Q9D4C9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms