Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syce1Q9D495 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syce1Q9D495 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms