Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gpn3Q9D3W4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gpn3Q9D3W4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms