Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rsph14Q9D3W1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rsph14Q9D3W1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms