Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pus10Q9D3U0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms