Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933436I01RikQ9D3T1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933436I01RikQ9D3T1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms