Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
1700034E13RikQ9D2T6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700034E13RikQ9D2T6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms