Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
D930007J09RikQ9D2K6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
D930007J09RikQ9D2K6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms