Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E1

Tssk3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk3Q9D2E1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tssk3Q9D2E1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms