Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SarnpQ9D1J3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SarnpQ9D1J3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms