Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D1F3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms