Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rtl8bQ9D1F0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms