Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl28Q9D1B9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl28Q9D1B9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms