Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Susd3Q9D176 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Susd3Q9D176 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms