Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Exosc7Q9D0M0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Exosc7Q9D0M0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms