Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Zbed3Q9D0L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbed3Q9D0L1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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