Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms