Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Acsl3Q9CZW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Acsl3Q9CZW4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms