Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nde1Q9CZA6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nde1Q9CZA6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms