Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rrs1Q9CYH6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rrs1Q9CYH6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms