Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ChtopQ9CY57 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms