Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PmpcbQ9CXT8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PmpcbQ9CXT8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms