Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT6

Kdm8, JmjC domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm8Q9CXT6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Kdm8Q9CXT6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Kdm8Q9CXT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms