Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sgo1Q9CXH7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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