Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmed5Q9CXE7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmed5Q9CXE7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms