Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm5Q9CXE0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prdm5Q9CXE0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms