Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rpusd4Q9CWX4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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