Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tdrd12Q9CWU0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms