Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MINDY3Q9CV28 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms