Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930553M12RikQ9CUH1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms