Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl28Q9CR40 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms