Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp5f1Q9CQQ7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atp5f1Q9CQQ7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms